La Région Sud mène une politique active de protection de la biodiversité à travers le classement des Réserves naturelles régionales, le soutien aux Parcs naturels régionaux et l'intégration des enjeux écologiques dans son Plan Climat. Elle finance également des actions de sensibilisation et de restauration des milieux naturels remarquables. La région se distingue par une biodiversité méditerranéenne particulièrement riche.