Regroupe les structures porteuses de SCoT pour échanger sur les pratiques de planification territoriale et représenter leurs intérêts auprès des pouvoirs publics. Elle contribue à l'aménagement durable des territoires. La Fédération des SCOT travaille à intégrer la biodiversité dans la planification territoriale . Elle accompagne les collectivités pour préserver les écosystèmes, les trames vertes et bleues, et les continuités écologiques dans les documents d'urbanisme. Son rôle est d' articuler développement durable et protection des milieux naturels à l'échelle des territoires.