Référent scientifique et technique indépendant, le Conservatoire botanique assure une mission de service public fondamentale de connaissance de la flore et de la végétation de l'Ouest de la France. Il peut également intervenir à différentes étapes des projets portés par des organismes publics, privés ou associatifs en fonction de leurs besoins et à différentes échelles : locales, départementales, régionales, interrégionales, nationales ou encore à l'étranger.