Financée par des départements et des communes en région Auvergne-Rhône-Alpes, l'EID Rhône-Alpes mène des actions de lutte contre la prolifération des espèces de moustiques nuisantes pour l'homme aussi bien dans les zones naturelles que dans les zones urbaines. Elle est également spécialisée dans la restauration, l’entretien et l’aménagement des milieux humides et elle est reconnue comme organisme gestionnaire d'espaces naturels.